Harry Saavedra Espinoza

Profesor Tiempo Completo Bioingeniería

hsaavedra@utec.edu.pe

Biografía

Líneas de investigación

Enseñanza

Publicaciones

Perfil profesional

El Dr. Harry G. Saavedra hizo su doctorado en Biofísica en la Universidad de Johns Hopkins, USA. Trabajó como investigador postdoctoral en la escuela de medicina de la misma universidad por 6 años. Durante este tiempo participó en proyectos de investigación sobre cáncer, enfermedades de la tiroides, neurodegenerativas y cardiacas. Durante sus estudios de doctorado realizó investigaciones en la modulación de funciones de enzimas. Durante sus estudios de maestría en ingeniería mecánica en la PUC-Rio Brasil, trabajó en el área de elementos finitos. Sus estudios de pregrado en ingeniería mecánica los realizó en la UNI. Como ingeniero mecánico trabajó en la industria pesquera, petrolera, metalmecánica y minera.Página web

Cargo

Profesor a Tiempo Completo de Bioingeniería

Líneas de investigación

Biofísica de Proteínas
Sub líneas
                - Diseño computacional de proteínas incluyendo nanocuerpos
                - Determinación de afinidades entre biomoléculas
                - Alosteria y modulación de función de proteínas
Actualmente se está trabajando en un artículo sobre el diseño de nanocuerpos usando algoritmos de inteligencia artificial (IA) y biofísica computacional. Se está colaborando con el Prof. Mario Bianchet (Johns Hopkins University) y el Prof. Alberto Donayre.
Diagnóstico de enfermedades por Imágenes Médicas
Sub líneas
                - Exploración médica con Ultrasonido (UT)
                - Diseño de nuevos métodos computacionales para la extracción de datos médicos
                - Diagnóstico de enfermedades vasculares usando UT y IA
En esta línea se está colaborando con el Prof. Ramiro Moro (University of Louisiana at Lafayette). Junto con él se está investigando en aplicaciones de las ecuaciones de Zoeppritz a la exploración médica usando UT.

Cursos:

Fundamentos de Bioingeniería : Este curso da una mirada global de la Bioingeniería como carrera. Se analizan los componentes de la parte biomédica y de la biotecnología con la visión del ciclo de la ingeniería; en cada proceso. Estudiaremos el alcance global y los problemas que se tienen a nivel local y regional donde la Bioingeniería se ha desarrollado y donde es una oportunidad de solución.

Tesis II : Este curso tiene como objetivo la culminación de la obtención de resultados de los análisis empezados en el curso Tesis I, así como la entrega del documento de la tesis de pregrado.

“Dynamics-Based Mechanism for Cold Adaptation of Enzymes”. Harry G. Saavedra, James Wrabl, Jeremy Anderson, Jing Li, and Vincent Hilser. Nature Link

“Mycobacterium tuberculosis ribosomal protein S1 (RpsA) and variants with truncated C-terminal end show absence of interaction with pyrazinoic acid ”. Katherine Vallejos-Sánchez, Juan M. Lopez, Ricardo Antiparra, Emily Toscano, Harry Saavedra, Daniela E. Kirwan, L. M. Amzel, R. H. Gilman, Helena Maruenda, Patricia Sheen and Mirko Zimic. Scientific Reports(Nature) Link

“Bilirubin Links Heme Metabolism to Neuroprotection by Scavenging Superoxide ”. Chirag Vasavda, Ruchita Kothari, Adarsha P. Malla, Robert Tokhunts, Anthony Lin, Ming Ji, Cristina Ricco, Risheng Xu, Harry G. Saavedra, Juan I. Sbodio, Adele M. Snowman, Lauren Albacarys, Lynda Hester, Thomas W. Sedlak, Bindu D. Paul and Solomon H. Snyder. Cell Chemical Biology 26, 1–11, October 17, Link

“Nudt19 is a renal CoA diphosphohydrolase with biochemical and regulatory properties that are distinct from the hepatic Nudt7 isoform ”. Stephanie A Shumar, Evan W Kerr, Werner J Gelden- huys, Grace E Montgomery, Paolo Fagone, Puchong Thirawatananond, Harry Saavedra, Sandra B Gabelli and Roberta Leonardi JBC, jbc. Link

“Structural insight into the inactivation of Mycobacterium tuberculosis non-classical transpeptidase Ldt M t2 by biapenem and tebipenem”. Mario A. Bianchet, Ying Pan, Leighanne Basta, Harry Saavedra, Evan Lloyd, Pankaj Kumar, Rohini Mattoo, Craig Townsend and Gyanu Lamichhane. BMC Biochemistry 18:8, May 2017, Link

“Genetically tunable frustration controls allostery in an intrinsically disordered transcription factor”. Jing Li, Jordan T White, Harry Saavedra, James O Wrabl, Hesam N Motlagh, Kaixian Liu, James Sowers, Trina A Schroer, E Brad Thompson and Vincent J Hilser eLife 2017;6:e30688. DOI: Link